MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mesotoga prima MesG1.Ag.4.2 chromosome

Total Repeats: 48535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017934	TAT	2	6	70	75	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389842921
2	NC_017934	GAA	3	9	85	93	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842921
3	NC_017934	TCA	2	6	186	191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842921
4	NC_017934	TGA	2	6	354	359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389842921
5	NC_017934	CTT	2	6	472	477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842921
6	NC_017934	TCT	2	6	511	516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842921
7	NC_017934	AAG	2	6	557	562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842921
8	NC_017934	AAC	2	6	620	625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389842921
9	NC_017934	GAA	2	6	652	657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842921
10	NC_017934	TTC	2	6	666	671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842921
11	NC_017934	GAG	2	6	791	796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389842921
12	NC_017934	CAG	2	6	811	816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842921
13	NC_017934	AGC	2	6	894	899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842921
14	NC_017934	TC	3	6	920	925	0 %	50 %	0 %	50 %	389842921
15	NC_017934	GAT	2	6	929	934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389842921
16	NC_017934	ACA	2	6	954	959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389842921
17	NC_017934	AGA	2	6	974	979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842921
18	NC_017934	AGT	2	6	1013	1018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389842921
19	NC_017934	AGAT	2	8	1032	1039	50 %	25 %	25 %	0 %	389842921
20	NC_017934	AAGA	2	8	1154	1161	75 %	0 %	25 %	0 %	389842921
21	NC_017934	AATCG	2	10	1162	1171	40 %	20 %	20 %	20 %	389842921
22	NC_017934	GGAGCA	2	12	1173	1184	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	389842921
23	NC_017934	GAA	2	6	1225	1230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842921
24	NC_017934	GAA	2	6	1303	1308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842921
25	NC_017934	ATG	2	6	1325	1330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389842921
26	NC_017934	CAA	2	6	1341	1346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389842921
27	NC_017934	ACG	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842921
28	NC_017934	ATA	2	6	1373	1378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389842921
29	NC_017934	AGTT	2	8	1567	1574	25 %	50 %	25 %	0 %	389842922
30	NC_017934	ATC	2	6	1604	1609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842922
31	NC_017934	ATGA	2	8	1652	1659	50 %	25 %	25 %	0 %	389842922
32	NC_017934	AGTT	2	8	1733	1740	25 %	50 %	25 %	0 %	389842922
33	NC_017934	ATC	2	6	1770	1775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842923
34	NC_017934	ATGA	2	8	1818	1825	50 %	25 %	25 %	0 %	389842923
35	NC_017934	AAT	2	6	1915	1920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389842923
36	NC_017934	ACT	2	6	2922	2927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842924
37	NC_017934	GTT	2	6	2928	2933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389842924
38	NC_017934	GAC	2	6	2961	2966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842924
39	NC_017934	AAG	2	6	2999	3004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842924
40	NC_017934	TTCT	2	8	3119	3126	0 %	75 %	0 %	25 %	389842924
41	NC_017934	TGA	2	6	3131	3136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389842924
42	NC_017934	TTG	3	9	3151	3159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389842924
43	NC_017934	TGC	2	6	3302	3307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389842924
44	NC_017934	GAA	2	6	3345	3350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842924
45	NC_017934	CGC	2	6	3377	3382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389842924
46	NC_017934	ACG	2	6	3403	3408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842924
47	NC_017934	GGT	2	6	3412	3417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389842924
48	NC_017934	CAG	2	6	3427	3432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842924
49	NC_017934	AG	3	6	3492	3497	50 %	0 %	50 %	0 %	389842924
50	NC_017934	ACG	2	6	3547	3552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842924
51	NC_017934	ACTT	2	8	3561	3568	25 %	50 %	0 %	25 %	389842924
52	NC_017934	GTA	3	9	3592	3600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389842924
53	NC_017934	AGC	2	6	3626	3631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842924
54	NC_017934	CAT	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842924
55	NC_017934	TTCA	2	8	3679	3686	25 %	50 %	0 %	25 %	389842924
56	NC_017934	GAT	2	6	3771	3776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389842924
57	NC_017934	AT	3	6	3810	3815	50 %	50 %	0 %	0 %	389842924
58	NC_017934	TG	3	6	3897	3902	0 %	50 %	50 %	0 %	389842925
59	NC_017934	CTT	2	6	3903	3908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842925
60	NC_017934	TTC	2	6	3913	3918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842925
61	NC_017934	CTC	2	6	3977	3982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389842925
62	NC_017934	AGA	2	6	4184	4189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842925
63	NC_017934	GTT	2	6	4212	4217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389842925
64	NC_017934	TCG	2	6	4218	4223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389842925
65	NC_017934	GCTC	2	8	4277	4284	0 %	25 %	25 %	50 %	389842925
66	NC_017934	GAA	2	6	4313	4318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842925
67	NC_017934	GAT	2	6	4320	4325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389842925
68	NC_017934	GCT	2	6	4373	4378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389842925
69	NC_017934	ACAG	2	8	4527	4534	50 %	0 %	25 %	25 %	389842925
70	NC_017934	TCA	2	6	4576	4581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842925
71	NC_017934	AAT	2	6	4751	4756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389842925
72	NC_017934	TAC	3	9	4782	4790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842925
73	NC_017934	AAG	2	6	4809	4814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842925
74	NC_017934	CTTT	2	8	4819	4826	0 %	75 %	0 %	25 %	389842925
75	NC_017934	TCG	2	6	4887	4892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389842925
76	NC_017934	TAC	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842925
77	NC_017934	TC	3	6	4915	4920	0 %	50 %	0 %	50 %	389842925
78	NC_017934	CTA	2	6	5039	5044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842925
79	NC_017934	GCG	2	6	5323	5328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389842925
80	NC_017934	TCC	2	6	5363	5368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389842925
81	NC_017934	TAT	2	6	5463	5468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389842925
82	NC_017934	TCT	2	6	5527	5532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842925
83	NC_017934	AC	3	6	5533	5538	50 %	0 %	0 %	50 %	389842925
84	NC_017934	TA	3	6	5628	5633	50 %	50 %	0 %	0 %	389842925
85	NC_017934	TCG	2	6	5677	5682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389842925
86	NC_017934	AG	3	6	5739	5744	50 %	0 %	50 %	0 %	389842925
87	NC_017934	CTCA	2	8	5760	5767	25 %	25 %	0 %	50 %	389842925
88	NC_017934	CTA	2	6	5969	5974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842925
89	NC_017934	CCG	2	6	6024	6029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389842925
90	NC_017934	CAG	2	6	6308	6313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842925
91	NC_017934	TTC	2	6	6316	6321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842925
92	NC_017934	TCT	2	6	6358	6363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842925
93	NC_017934	GAA	2	6	6420	6425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842925
94	NC_017934	TTC	2	6	6443	6448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842925
95	NC_017934	TTCA	2	8	6470	6477	25 %	50 %	0 %	25 %	389842925
96	NC_017934	GTC	2	6	6543	6548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389842925
97	NC_017934	ACGATT	2	12	6681	6692	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	389842925
98	NC_017934	TTC	2	6	6712	6717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842925
99	NC_017934	GT	3	6	6755	6760	0 %	50 %	50 %	0 %	389842925
100	NC_017934	AGC	2	6	6794	6799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842925
101	NC_017934	GAA	2	6	6813	6818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842925
102	NC_017934	CAA	2	6	6836	6841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389842925
103	NC_017934	GGCTGG	2	12	6903	6914	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	389842925
104	NC_017934	GTTAT	2	10	6988	6997	20 %	60 %	20 %	0 %	389842925
105	NC_017934	CT	3	6	7039	7044	0 %	50 %	0 %	50 %	389842925
106	NC_017934	CTTC	2	8	7064	7071	0 %	50 %	0 %	50 %	389842925
107	NC_017934	CAG	2	6	7091	7096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842925
108	NC_017934	GTC	2	6	7122	7127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389842925
109	NC_017934	TTCC	2	8	7144	7151	0 %	50 %	0 %	50 %	389842925
110	NC_017934	GAC	2	6	7191	7196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842925
111	NC_017934	GAA	2	6	7215	7220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389842925
112	NC_017934	GAC	2	6	7248	7253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842925
113	NC_017934	ATT	2	6	7276	7281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389842925
114	NC_017934	CGA	2	6	7286	7291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389842925
115	NC_017934	GGA	2	6	7346	7351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389842925
116	NC_017934	CGG	2	6	7496	7501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389842925
117	NC_017934	GAG	2	6	7626	7631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389842925
118	NC_017934	GAAG	2	8	7675	7682	50 %	0 %	50 %	0 %	389842925
119	NC_017934	ACA	2	6	7716	7721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389842925
120	NC_017934	GATT	2	8	7727	7734	25 %	50 %	25 %	0 %	389842925
121	NC_017934	GTT	2	6	7743	7748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389842925
122	NC_017934	TC	3	6	7785	7790	0 %	50 %	0 %	50 %	389842925
123	NC_017934	TCAA	2	8	7830	7837	50 %	25 %	0 %	25 %	389842925
124	NC_017934	AG	3	6	7940	7945	50 %	0 %	50 %	0 %	389842925
125	NC_017934	CTA	2	6	7946	7951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842925
126	NC_017934	TGA	2	6	7952	7957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389842925
127	NC_017934	TGC	2	6	8083	8088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389842925
128	NC_017934	GAG	2	6	8109	8114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389842925
129	NC_017934	ACT	3	9	8161	8169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389842925
130	NC_017934	CTT	3	9	8213	8221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389842925
131	NC_017934	AGG	2	6	8228	8233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389842925
132	NC_017934	GGA	2	6	8257	8262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389842925
133	NC_017934	GTG	2	6	8272	8277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389842925
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497	NC_017934	ACA	2	6	27818	27823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389842945
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